Exploration des structures biologiques par evolution artificielle

by Guillaume Beslon (LIRIS, IXXI, INSA-Lyon)

Thursday 9 Oct 2008, 11:00 → 12:00 Europe/Zurich

Auditorium (LAPTH, Annecy-le-Vieux)

A l'echelle genetique et moleculaire, les organismes biologiques apparaissent comme etonnamment structures, que ce soit au niveau de la repartition des genes et des sequences non-codantes sur les genomes ou au niveau de la topologie des reseaux genetiques et moleculaires. Certaines de ces structures semblent universelles, d'autres seraient caracteristiques de certains groupes d'organismes, d'autres encore caracteriseraient plutot le mode de vie des organismes. L'observation de ces structures pose directement la question de leur origine a travers l'histoire evolutive des organismes : ces structures sont-elles apparues car elles apportent un avantage selectif aux organismes (et, si oui, lequel) ou sont-elles un effet indirect des processus mutationnels qui ont faconnes les genomes ? Peuvent-elles etre indirectement selectionnees parce qu'elles augmentent l'efficacite de l'evolution elle-meme ? La biologie peine a aborder directement de telles questions et les methodes de modelisation et de simulation sont alors d'un precieux secours. Apres avoir presente le contexte de ce travail, je presenterai le modele d'evolution artificielle "aevol" qui permet de simuler l'evolution a long terme de structures genetiques et d'observer l'emergence de structures genetiques en relation avec les principaux parametres de l'evolution. Je presenterai ensuite les principaux resultats obtenus grace a ce modele. Nous verrons alors que de nombreux mecanismes contre-intuitifs peuvent faconner les genomes des lors que l'evolution ne selectionne pas seulement les organismes les plus aptes a survivre mais aussi les plus aptes a evoluer.